高效in vitro包装λDNA试剂盒

● 包装效率高

1×108 pfu/μg Standard λDNA 以上

 

● 操作简单

Freeze/Thaw Lysate和Sonicated Extract已添加至1根管中

 

包装的大致过程:

①外壳前体的形成

②将在cos位点连接形成多联体的λ噬菌体DNA插入外壳前体

③ 在cos位点裂解

④噬菌体颗粒成熟

 

用途

● λ噬菌体DNA的in vitro包装

cDNA文库构建

● 粘粒载体(Charomid DNA)的in vitro包装

 

试剂盒组成

● 包装提取物 30 μL×3 支(黄色管)

● λDNA标准品 20 μL×1 本(透明管)

● 大肠杆菌VCS257指示物 10 μL×1 本(蓝色管)

※  产品签收后,请立即放入-80℃冷冻室中储存,请勿使用液氮。

※ 解冻后的包装提取物无法再次储存,请在解冻后立即使用,并在单次实验中使用完毕。

 

使用示例

以下为使用本试剂盒中包含的λ DNA标准品(0.04 μg/μL)进行对照实验的步骤。

 

< λ噬菌体DNA的in vitro包装>

为避免产生气泡,通过移液或使用吸头混合溶液时,请使用口径较大的吸头(或将吸头剪去约0.5 cm)。

 

A 包装的反应

① 将包装提取物从-80℃的冷冻库中取出后置于冰上,并迅速溶解(无需Tapping)。

 

② 加入1~6 μL DNA溶液(~1 μg/μL)※1),使用吸头混匀。(注意不要起泡)

 

③ 室温(约22℃)下静置1~2 h。

 

④ 加入0.5~1 mL SM Buffer (Phage Buffer)※2)平稳倒置进行混合(如需在4℃下保存数日,则需添加1滴氯仿)。

 

B-1 宿主菌的制备

① 向2 mL的LB broth中添加70 μL的20%麦芽糖,制备培养基。通过菌落分离※3获得大肠杆菌VCS257的单菌落,接种至培养基,并于37℃下摇瓶培养过夜。

 

② 取1 mL菌液至1.5 mL离心管中,离心(1,500×g,5 min)后去除上清,向获得的沉淀中加入0.5 mL的10 mM MgCl2(或MgSO4),使用搅拌器悬浊后置于冰中(此步骤中稀释的菌液需立即用于B-2②)。

 

B-2 导入宿主菌

① 稍微离心(3,000×g,5ec)包装反应后的噬菌体液,沉降残留,使用SM Buffer 105倍(100,000倍)稀释4)上清。

 

② 向15 mL管中加入100 μL的B-1②制备的菌液和100 μL的B-2①中105倍稀释的噬菌体液,吹打混匀后在室温(约22℃)下放置15 min。

 

③ 迅速与50℃左右保温的3 mL M Top琼脂(LB Top琼脂)※5)混合,倒入已凝固的LB平板上。

 

④ 待倒入的M Top琼脂充分凝固后,倒置使培养基部分朝上,在37℃下静置培养过夜。

 

⑤ 计数形成的噬菌斑数量,计算包装效率。

 

※1)进行对照实验时,需添加5 μL(0.2 μg)λDNA标准品(0.04 μg/μL)。根据对照试验中得到的包装效率,如出现重组DNA包装效率低的情况,请探讨DNA溶液的浓度。

 

※2)SM Buffer (Phage Buffer):

以上成分添加H2O至500 mL,高压灭菌后在4℃下储存。

 

※3)在LB平板(不含抗生物质)上使用划线培养法,挑选出与其他菌落分离开的单菌落。

 

※4)稀释示例(使用搅拌器混匀)

 

※5)M Top琼脂(LB Top琼脂)

以上成分添加H2O至1 L,高压灭菌后在4℃下储存。

使用时可通过微波炉等加热溶解,取所需量,加入经过滤灭菌的1 M MgCl2至最终浓度为10 mM,并在约50 °C 的水浴中保温。

 

注意事项

● 本产品对甲基化DNA有轻微的限制活性,因此在包装高度甲基化的基因组DNA时效率可能会降低。

● 当使用含有酒精共沉淀剂(如乙醇胺)的DNA时,效率也会降低。

 

参考文献

1)Sambrook, J. et al. :“ Molecular Cloning”, A Laboratory Manual, 2nd ed., 2, 3(1989)

2)Rosenberg, S. M. et al. :  Gene., 38, 165(1985)

3)Rosenberg, S. M. et al. :  Gene., 39, 313(1987)

 

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